春日部来的

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Python自动化运维

利用python管理系统、文件和应用程序,自动化执行,提高工作效率。查找文件需要导入自带的os模块,re模块用于正则匹配。import os import re def find(pattern, path='.', file_only=False, dir_only=False): ''' 递归查找指定路径下符合要求的文件和(或)路径。 ''' res = [] for root, dirs, files in os.walk(path)...

快速傅里叶变换(FFT)

FFT(Fast Fourier Transformation),中文名快速傅里叶变换,是离散傅氏变换的快速算法,它是根据离散傅氏变换的奇、偶、虚、实等特性,对离散傅立叶变换的算法进行改进获得的。 学习FFT之前,需要了解一些有关复数和多项式的知识。原文:https://blog.csdn.net/Flag_z/article/details/99163939FFT的实现思路:

【资料】蛋白质组学分析

目录 1. 蛋白质组学研究方法概述(上) 1. 蛋白质组学研究方法概述(下) 2. 蛋白质组学样品前处理(1) 2. 蛋白质组学样品前处理(2) 2. 蛋白质组学样品前处理(3) 2. 蛋白质组学样品前处理(4) 3. 蛋白质谱的原理及使用(1) 3. 蛋白质谱的原理及使用(2) 3. 蛋白质谱的原理及使用(3) 3. 蛋白质谱的原理及使用(4) 4. 蛋白质组学数据分析基础(1) 4. 蛋白质组学数据分析基础(2) 4. 蛋白质组学数据分析基础(3) 说明:此篇笔记...

数据动态可视化,python-plotly.express使用基础

利用plotly快速实现数据的动态可视化,生成一定顺序的动画: px是一个高级api,除了可视化为scatter,还可以由DataFrame数据直接生成 'bar', 'bar_polar', 'box', 'choropleth_mapbox', 'density_contour', 'density_heatmap', 'density_mapbox', 'histogram', 'line', 'line_3d', 'line_geo', 'line_mapbox', 'line_polar'...

Python-seaborn 数据可视化

import numpy as np import pandas as pd import matplotlib.pyplot as plt import seaborn as snsIn [28]:crash_df=sns.load_dataset("car_crashes")In [20]:crash_df.head()Out[20]:totalspeedingalcoholnot_distractedno_previousins_premiumins_lossesabbrev018.87....

OTU分析和作图

韦恩图 Venn   venn 图可用于统计多个样品中所共有和独有的OTU 数目,可以比较直观的表现环境样品的OTU 数目组成相似性及重叠情况。通常情况下,分析时选用相似水平为97%的OTU 样品表。 参考文献:   Fouts DE, Szpakowski S, Purushe J, Torralba M, Waterman RC, et al. (2012) Next Generation Sequencing to Define Prokaryotic and Fungal Diversit...

【BioStar】存在哪些生物信息学子领域

DNA sequencing as initially valued for revealing the DNA content of a cell. It may come as a surprise to many, however, that the most significant promise for the future of bioinformatics might lie in other applications. In general, most bioinformatics ...

Python分析冠状病毒基因组 | Biopython构建系统发生树,以冠状病毒基因组序列为例(COVID-19,SARS,MERS,EBOLA),最大似然估计法(ML)

系统发生树 定义 系统发生树(phylogenetic tree)是表明被认为具有共同祖先的各物种相互间演化关系的树分类是否有根? - 有根树:具有方向的树 - 无根树:没有方向,其中线段的两个演化方向都有可能基因树和物种树构建方法计算的精度和时间均依次增大非加权分组平均法:UPGAM(Unweighted pair group method with arithmetic mean)矩阵法:邻接法 neighbor-joining (NJ)简约法:最大简约法 maximum parsimony (...

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